MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02

Total Repeats: 4088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018501	A	7	7	33	39	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018501	GCT	2	6	61	66	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018501	TAA	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018501	CAAAA	2	10	84	93	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018501	A	6	6	90	95	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018501	AT	3	6	205	210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018501	TCAA	2	8	263	270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018501	ATT	2	6	277	282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018501	TTA	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018501	A	6	6	321	326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018501	T	6	6	355	360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018501	ATA	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018501	ATT	2	6	403	408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018501	TAAA	2	8	426	433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018501	GAT	2	6	442	447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018501	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	402558406
17	NC_018501	ATCA	2	8	499	506	50 %	25 %	0 %	25 %	402558406
18	NC_018501	ATCT	2	8	608	615	25 %	50 %	0 %	25 %	402558406
19	NC_018501	A	7	7	628	634	100 %	0 %	0 %	0 %	402558406
20	NC_018501	CCAA	2	8	669	676	50 %	0 %	0 %	50 %	402558406
21	NC_018501	GCT	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558406
22	NC_018501	TAC	2	6	736	741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558406
23	NC_018501	ATGA	2	8	840	847	50 %	25 %	25 %	0 %	402558406
24	NC_018501	AGAA	2	8	884	891	75 %	0 %	25 %	0 %	402558406
25	NC_018501	TTG	2	6	898	903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558406
26	NC_018501	T	6	6	928	933	0 %	100 %	0 %	0 %	402558406
27	NC_018501	ATA	2	6	949	954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558406
28	NC_018501	TA	3	6	958	963	50 %	50 %	0 %	0 %	402558406
29	NC_018501	A	6	6	1010	1015	100 %	0 %	0 %	0 %	402558406
30	NC_018501	TA	3	6	1126	1131	50 %	50 %	0 %	0 %	402558406
31	NC_018501	TGA	2	6	1145	1150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558406
32	NC_018501	AGGAC	2	10	1240	1249	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018501	TAAA	2	8	1327	1334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018501	AC	3	6	1353	1358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018501	GT	3	6	1384	1389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018501	T	6	6	1392	1397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018501	AGG	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018501	A	6	6	1458	1463	100 %	0 %	0 %	0 %	402558407
39	NC_018501	A	6	6	1470	1475	100 %	0 %	0 %	0 %	402558407
40	NC_018501	TTGTA	2	10	1513	1522	20 %	60 %	20 %	0 %	402558407
41	NC_018501	TAA	2	6	1566	1571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558407
42	NC_018501	TAG	2	6	1647	1652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558407
43	NC_018501	ATA	2	6	1689	1694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558407
44	NC_018501	ATTTA	2	10	1711	1720	40 %	60 %	0 %	0 %	402558407
45	NC_018501	AATA	2	8	1789	1796	75 %	25 %	0 %	0 %	402558407
46	NC_018501	TGA	2	6	1864	1869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558407
47	NC_018501	CAG	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558407
48	NC_018501	A	6	6	1903	1908	100 %	0 %	0 %	0 %	402558407
49	NC_018501	TGA	2	6	1957	1962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558407
50	NC_018501	TAG	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558407
51	NC_018501	TAT	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558407
52	NC_018501	GTG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558407
53	NC_018501	A	7	7	2098	2104	100 %	0 %	0 %	0 %	402558407
54	NC_018501	TGA	2	6	2107	2112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558407
55	NC_018501	AAGAA	2	10	2133	2142	80 %	0 %	20 %	0 %	402558407
56	NC_018501	TCAT	2	8	2163	2170	25 %	50 %	0 %	25 %	402558407
57	NC_018501	ATA	2	6	2208	2213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558407
58	NC_018501	CT	3	6	2255	2260	0 %	50 %	0 %	50 %	402558407
59	NC_018501	CGT	2	6	2276	2281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558407
60	NC_018501	GAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558407
61	NC_018501	TGG	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558407
62	NC_018501	TAT	2	6	2337	2342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558407
63	NC_018501	AT	3	6	2382	2387	50 %	50 %	0 %	0 %	402558407
64	NC_018501	ATTT	2	8	2395	2402	25 %	75 %	0 %	0 %	402558407
65	NC_018501	GCA	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558407
66	NC_018501	CAT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558407
67	NC_018501	TGA	2	6	2551	2556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558407
68	NC_018501	ACA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558407
69	NC_018501	TCA	2	6	2648	2653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558407
70	NC_018501	CAG	2	6	2712	2717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558407
71	NC_018501	AGG	2	6	2733	2738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558407
72	NC_018501	TAA	2	6	2767	2772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558407
73	NC_018501	TAT	2	6	2836	2841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558407
74	NC_018501	TAA	2	6	2961	2966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018501	TA	3	6	2968	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018501	AC	3	6	2998	3003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018501	GT	3	6	3029	3034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018501	T	6	6	3037	3042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018501	AGG	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018501	GAAA	2	8	3076	3083	75 %	0 %	25 %	0 %	402558408
81	NC_018501	AC	3	6	3141	3146	50 %	0 %	0 %	50 %	402558408
82	NC_018501	ACA	2	6	3344	3349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558408
83	NC_018501	TGT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558408
84	NC_018501	CAG	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558408
85	NC_018501	A	6	6	3504	3509	100 %	0 %	0 %	0 %	402558408
86	NC_018501	GAA	2	6	3518	3523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558408
87	NC_018501	TTCG	2	8	3653	3660	0 %	50 %	25 %	25 %	402558408
88	NC_018501	GGA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558408
89	NC_018501	TAT	2	6	3670	3675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558408
90	NC_018501	TGT	2	6	3685	3690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558408
91	NC_018501	ATC	2	6	3698	3703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558408
92	NC_018501	GTT	2	6	3781	3786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558408
93	NC_018501	AGA	2	6	3922	3927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558408
94	NC_018501	GCT	2	6	3958	3963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558408
95	NC_018501	A	7	7	4028	4034	100 %	0 %	0 %	0 %	402558408
96	NC_018501	AT	3	6	4151	4156	50 %	50 %	0 %	0 %	402558409
97	NC_018501	AGC	2	6	4218	4223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558409
98	NC_018501	AGA	2	6	4231	4236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558409
99	NC_018501	TAT	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558409
100	NC_018501	ATG	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558409
101	NC_018501	TTACT	2	10	4352	4361	20 %	60 %	0 %	20 %	402558409
102	NC_018501	GAA	2	6	4412	4417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558409
103	NC_018501	TTC	2	6	4475	4480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558409
104	NC_018501	CATC	2	8	4595	4602	25 %	25 %	0 %	50 %	402558409
105	NC_018501	CCT	2	6	4625	4630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558409
106	NC_018501	AT	3	6	4662	4667	50 %	50 %	0 %	0 %	402558409
107	NC_018501	CTA	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558409
108	NC_018501	ATT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558409
109	NC_018501	TTA	2	6	4767	4772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558409
110	NC_018501	TA	3	6	4807	4812	50 %	50 %	0 %	0 %	402558409
111	NC_018501	AAGCA	2	10	4830	4839	60 %	0 %	20 %	20 %	402558409
112	NC_018501	TAA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558409
113	NC_018501	ACA	2	6	4921	4926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558409
114	NC_018501	ACA	2	6	4985	4990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558409
115	NC_018501	ATCATT	2	12	5076	5087	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018501	T	6	6	5086	5091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018501	ATA	2	6	5245	5250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018501	AT	3	6	5279	5284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018501	AT	3	6	5311	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018501	GAT	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558410
121	NC_018501	GT	3	6	5443	5448	0 %	50 %	50 %	0 %	402558410
122	NC_018501	TGC	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558410
123	NC_018501	A	6	6	5481	5486	100 %	0 %	0 %	0 %	402558410
124	NC_018501	AGA	2	6	5531	5536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558410
125	NC_018501	ATG	2	6	5613	5618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558410
126	NC_018501	AAC	2	6	5620	5625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558410
127	NC_018501	ATT	2	6	5670	5675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018501	TA	4	8	5695	5702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018501	CTT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018501	AT	3	6	5761	5766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018501	TATT	2	8	5772	5779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018501	T	6	6	5809	5814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018501	CTT	2	6	5869	5874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018501	TA	4	8	5889	5896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018501	T	7	7	5899	5905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018501	GAA	2	6	5930	5935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018501	T	7	7	5940	5946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018501	ACC	2	6	5965	5970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018501	TAA	2	6	5991	5996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018501	T	6	6	6028	6033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018501	GA	3	6	6047	6052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018501	A	6	6	6083	6088	100 %	0 %	0 %	0 %	402558411
143	NC_018501	TTTA	2	8	6136	6143	25 %	75 %	0 %	0 %	402558411
144	NC_018501	TAC	2	6	6208	6213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558411
145	NC_018501	GTA	2	6	6300	6305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558411
146	NC_018501	TAAAA	2	10	6313	6322	80 %	20 %	0 %	0 %	402558411
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148	NC_018501	AATA	2	8	6373	6380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018501	T	7	7	6396	6402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018501	AGAA	2	8	6498	6505	75 %	0 %	25 %	0 %	402558412
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179	NC_018501	TCTT	2	8	7592	7599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_018501	GTT	2	6	7676	7681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_018501	AAT	2	6	7885	7890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_018501	TTGA	2	8	11499	11506	25 %	50 %	25 %	0 %	402558418
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273	NC_018501	ATT	3	9	11626	11634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_018501	TACA	2	8	11635	11642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
275	NC_018501	CAG	2	6	11645	11650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_018501	AAG	2	6	11656	11661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_018501	GAA	3	9	11732	11740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_018501	CAA	2	6	11810	11815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_018501	AGA	2	6	11839	11844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_018501	AATT	2	8	11860	11867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_018501	ATA	2	6	11891	11896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018501	GTAT	2	8	11976	11983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018501	ATT	2	6	12006	12011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_018501	ATT	2	6	12018	12023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_018501	GAA	2	6	12041	12046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_018501	G	6	6	12075	12080	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018501	CAT	2	6	12107	12112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_018501	CGA	2	6	12127	12132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_018501	TTTC	2	8	12259	12266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
290	NC_018501	ATG	3	9	12336	12344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_018501	GAA	2	6	12395	12400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_018501	A	6	6	12412	12417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_018501	GAA	2	6	12449	12454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558419
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302	NC_018501	TTAC	2	8	12788	12795	25 %	50 %	0 %	25 %	402558419
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321	NC_018501	TAA	2	6	13936	13941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_018501	AAT	3	9	13943	13951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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396	NC_018501	TTG	2	6	17121	17126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558426
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401	NC_018501	ACA	2	6	17636	17641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558427
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403	NC_018501	AG	4	8	17732	17739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
404	NC_018501	CT	4	8	17756	17763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
405	NC_018501	TCTA	2	8	17767	17774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
406	NC_018501	A	6	6	17774	17779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_018501	GAG	2	6	17780	17785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_018501	AGA	2	6	17823	17828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558428
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412	NC_018501	GGA	2	6	17878	17883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558428
413	NC_018501	AGA	2	6	17940	17945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558428
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491	NC_018501	AGAT	2	8	21401	21408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_018501	ATT	2	6	21743	21748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558432
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